Высшим органов управления Общества является общее собрание акционеров ПАО «Кокс». Решения общего собрания акционеров принимаются как путем очного, так и заочного голосования. Годовое общее собрание акционеров (ГОСА) проводится не ранее чем через 2 месяца и не позднее чем через 6 месяцев после окончания отчетного года.
Совет директоров осуществляет общее руководство деятельностью Общества в соответствии с компетенциями, определенными уставом.
Оперативным руководством текущей деятельностью организации занимается единоличный исполнительный орган (ЕИО). В настоящий момент функции ЕИО переданы управляющей компании (ООО УК «ПМХ»).